Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rdm1Q9CQK3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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