Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Tmed6Q9CQG0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Tmed6Q9CQG0 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms