Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Use1Q9CQ56 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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