Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ssxb1Q9CPU1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssxb1Q9CPU1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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