Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt23Q99PS0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt23Q99PS0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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