Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf2a1Q99PM3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf2a1Q99PM3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms