Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sf3b1Q99NB9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sf3b1Q99NB9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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