Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hdac9Q99N13 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms