Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp1b4Q99ME6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp1b4Q99ME6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms