Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PtprtQ99M80 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprtQ99M80 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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PtprtQ99M80 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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PtprtQ99M80 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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PtprtQ99M80 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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PtprtQ99M80 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PtprtQ99M80 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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PtprtQ99M80 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprtQ99M80 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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