Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chmp1b1Q99LU0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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