Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms