Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nlgn1Q99K10 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlgn1Q99K10 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms