Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Higd1bQ99JY6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Higd1bQ99JY6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Higd1bQ99JY6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Higd1bQ99JY6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Higd1bQ99JY6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Higd1bQ99JY6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Higd1bQ99JY6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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