Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ophn1Q99J31 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ophn1Q99J31 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ophn1Q99J31 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ophn1Q99J31 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ophn1Q99J31 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ophn1Q99J31 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ophn1Q99J31 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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