Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms