Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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