Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Med28Q920D3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms