Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx18Q91ZR2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx18Q91ZR2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms