Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usb1Q91W78 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usb1Q91W78 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usb1Q91W78 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usb1Q91W78 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usb1Q91W78 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usb1Q91W78 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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