Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col26a1Q91VF6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms