Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms