Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cabp4Q8VHC5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp4Q8VHC5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms