Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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