Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Stx18Q8VDS8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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