Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ttc8Q8VD72 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ttc8Q8VD72 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc8Q8VD72 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms