Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nup58Q8R332 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nup58Q8R332 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nup58Q8R332 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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