Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mrpl47Q8K2Y7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mrpl47Q8K2Y7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Mrpl47Q8K2Y7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl47Q8K2Y7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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