Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Depp1Q8K2F3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms