Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c1Q8K284 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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