Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Phc3Q8CHP6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Phc3Q8CHP6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phc3Q8CHP6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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