Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hpf1Q8CFE2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hpf1Q8CFE2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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