Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8CF25 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8CF25 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms