Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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