Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrif1Q8CDD9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrif1Q8CDD9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrif1Q8CDD9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrif1Q8CDD9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrif1Q8CDD9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrif1Q8CDD9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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