Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg4aQ8C9S8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg4aQ8C9S8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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