Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Q8C708 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q8C708 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q8C708 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q8C708 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms