Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp20Q8C6M1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp20Q8C6M1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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