Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ccdc113Q8C5T8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc113Q8C5T8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc113Q8C5T8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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