Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NkrfQ8BY02 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NkrfQ8BY02 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms