Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp38Q8BW70 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms