Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx17Q8BVL3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms