Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep55Q8BT07 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms