Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TicrrQ8BQ33 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TicrrQ8BQ33 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms