Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp1Q8BJQ2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp1Q8BJQ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp1Q8BJQ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp1Q8BJQ2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Usp1Q8BJQ2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp1Q8BJQ2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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