Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smarcal1Q8BJL0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smarcal1Q8BJL0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smarcal1Q8BJL0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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