Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clrn3Q8BHH8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clrn3Q8BHH8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn3Q8BHH8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms