Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Atg4dQ8BGV9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Atg4dQ8BGV9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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