Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg4bQ8BGE6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg4bQ8BGE6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Atg4bQ8BGE6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4bQ8BGE6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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