Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd6Q8BGE4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms